Диагностическая система для качественного анализа нуклеиновых кислот Veredus Laboratories VerePLEX™ Biosystem

Описание:

VerePLEX™ Biosystem позволяет проводить до 50 тестов за одну реакцию, что значительно сокращает требуемое для анализа количество образца, расходных материалов и усилий, при этом, увеличивает эффективность анализа, по сравнению с аналогами.

Система VerePLEX™ Biosystem была создана на основе передовых разработок в области молекулярной биологии, микрофлюидики и микроэклектроники, и совмещает принципы анализа на биочипе с одной из базовых  молекулярно-биологических техник  – полимеразной цепной реакцией (ПЦР). 

Система  VerePLEX™ Biosystem состоит из системы контроля температуры (TCS) – самостоятельного модульного прибора для установки и контроля температурных циклов (до 5 одновременно) для ПЦР и реакций гибридизации, которые протекают в чипе VereChipTM, а также из оптического считывающеего устройства (OR) – прибора для получения изображений с VereChipTM, который получает и анализирует сигнал флуоресценции с микрочипа в диапазоне 670-730 нм за несколько секунд. Система управляется с помощью специализированного ПО с дружественным интерфейсом, позволяющего управлять процессами на каждой стадии и анализировать полученные результаты. В комплект также входит устройство считывания штрих-кодов.

Система позволяет проводить высокоточный анализ в короткие сроки, она проста в управлении, портативна и надёжна, благодаря отсутствию движущихся частей, требует минимального технического обслуживания.

Области применения:

медицинская диагностика (определение  онкомаркеров, диагностика инфекций и т.п.),

идентификация возбудителей биологического оружия,

контроль качества пищевых продуктов и мн. др.

Преимущества:

• быстрые результаты анализов, необходимые для экспресс-диагностики (на 40% быстрее других диагностических систем – около 2 часов)
• эта компактная система оптимизирована и автоматизирована таким образом, что даже неспециалист может проводить на ней сложные молекулярно-биологические эксперименты, а также диагностику в присутствии пациента
• возможность увеличить производительность системы с помощью добавления дополнительных модулей TCS
• тонкая настройка параметров ПЦР под различные условия
• возможность проведения нескольких анализов одновременно для определения разных нуклеиновых кислот – например, можно проводить дифференциацию разных патогенов со сходной симптоматикой или мультиплексный анализ биомаркеров для индивидуально подобранной терапии
• хорошо подходит для широкого круга задач, требующих быстрого получения результатов молекулярно-биологических тестов: исследования в больницах, поликлиниках и диспансерах.

Протокол работы VerePLEX™ Biosystem

Технология VereChip™

VereChip™ - это разработанный компанией STMicroelectronics кремниевый биочип, сочетающий в себе технологию микроэлектромеханических систем (MEMS) и микроструйной техники, обеспечивающей сочетание мультиплексной амплификации нуклеиновых кислот и количественного анализа полученного продукта с последующей гибридизацией на микрочипе средней плотности. Это позволяет проводить сотни тестов в пределах одной реакции.     

Благодаря встроенным кремниевым нагревателям, температурным сенсорам и малому объёму (25 мкл), ПЦР-модуль даёт быстрый нагрев и охлаждение, требуемые для надёжной ПЦР по конечной точке, погрешность контроля температуры ± 0,1°C.  

Модуль для детекции полученных ампликонов на чипе средней плотности содержит до 400 точек. Микрочип содержит набор контрольных зондов, находящихся на определённых местах, а также специфические зонды для конкретных исследований. Модуль микрочипа связан с ПЦР-модулем, они оба управляются с помощью датчиков и ПО. Модуль микрочипа прочитывает ампликон после гибридизации всего за 4 секунды.   

Под кремниевой поверхностью чипа находится несколько слоёв, формирующих оптический блок. Он значительно увеличивает чувствительность системы.

Микроструйная техника, используемая для ПЦР и гибридизации, позволяет пользоваться чипом даже неспециалисту и значительно упрощает лабораторную работу.      

Химия поверхности на чипе оптимизирована таким образом, чтобы обеспечить биосовместимость, эффективную амплификацию и гибридизацию, что гарантирует достоверные и воспроизводимые результаты. Благодаря оптическим свойствам поверхности, микрочип обладает высокой чувствительностью.      

Технология биочипов имеет большие перспективы для мультиплексных молекулярных исследований, обеспечивает компактность, интеграцию и автоматизацию, применяется во многих областях: в медицине (в том числе – индивидуально подобранной терапии и  онкологических исследованиях), пищевой промышленности, сельском хозяйстве, исследованиях по предотвращению биологической угрозы, судмедэкспертизе и многих других.  

Спецификация:

• биочип представляет собой пластиковую пластинку размером 75,5 х 25 х 0,2 мм с закреплённым на ней кремниевым микрочипом
• каждый реакционный центр содержит встроенный температурный сенсор и нагреватель
• термисторы откалиброваны с точностью до 1°C по стандарту NIST
• объём камеры для ПЦР – 25 мкл
• объём камеры для гибридизации – 30 мкл
• система подачи жидкостей - микропипетка
• система герметизации камер для ПЦР/гибридизации – на основании хомутов
• типы нуклеиновых кислот, с которыми работает микрочип  – ДНК, РНК
• типы ПЦР, используемой на чипе – мультиплексная ПЦР/ real-time ПЦР
• иапазон флуоресценции, испускаемой красителем: 670 – 730 нм
• количество точек на чипе – до 400
• размер стандартной матрицы – 6 х 21 точка (126 точек)
• средний размер точки – 120 нм
• стандартное расстояние между точками – 250 нм
• материал зондов – олигонуклеотиды
• контрольные зонды – 26 шт. в фиксированных положениях
• специфические зонды – 100 шт.