Программный пакет для сбора данных и их анализа SVI Huygens

VI-HuPro

Huygens Professional. Включает средство автоматизации batch-processor. Требует хотя-бы одной оптической опции (см ниже)..

Широкие возможности для деконволюции изображений с возможностью выбора множества различных алгоритмов. Измерения функций рассеивания (PSF). 4-мерные срезы и проекции. Множество инструментов анализа. 64-битные версии для всех платформ.

SVI-CF

Confocal optical option (Оптическая опция для конфокальной микроскопии). Позволяет проводить обработку изображений с учетом свойств, указанных в файлах для конфокальных снимков.

SVI-WF

Widefield & Brightfield optical option (Оптическая опция для широкопольной и светлопольной микроскопии). Позволяет учитывать параметры и особенности широкопольных снимков. Тестирование и коррекция мерцания, нестабильности ламп освещения, …

SVI-NK

Spinning Disc optical option (Оптическая опция для микроскопии с вращающимся диском).

Позволяет проводить обработку изображений с учетом свойств, указанных в файлах для снимков, сделанных на микроскопах с вращающимся диском.

SVI-MP

Multi photon optical option (Оптическая опция мультифотонной микроскопии). Позволяет учитывать особенности и свойства снимков, полученных с помощью мультифотонной микроскопии.

SVI-PSF

PSF Distiller. Опциональный помощник для измерения функций рассеивания (Point Spread Function) в программах Huygens Essential и Professional.

SVI- TIME

Time option (Опция для работы с временными рядами) 

Просмотр и вырезание в 4-мерных стеках изображений. Объемная деконволюция с учетом коррекции мерцания для любых типов микроскопов. Коррекция Z-дрейфа для конфокальных и мультифотонных серий изображений. Коррекция изменений фона со временем. Все виды коррекции выполняются одновременно за 1 проход. Коррекции во времени: 4D Gaussian, Laplacian, PlotFlux.

SVI-VACM

Visualization & Analysis bundle (Пакет анализа и визуализации) доступно 4 опции

Рендеринг поверхности - Surface Renderer

Анализ колокализации по пикселям - Co-localization Analyzer (pixel based)

Анализ колокализации с учетом объектов - Object Analyzer & Co localization (Object based)

Создание анимаций - MovieMaker

SVI-OS

ObjectStabilizer (Стабилизатор объектов)

Помощник для стабилизации изображения для 2D и 3D временных серий, а также для срезов в 3D-сериях. Измерения и коррекция смещения объектов на субпиксельном уровне, например движения клеток, температурного дрейфа или дрожания.

SVI-OT

Object Tracking (Отслеживание объектов).

Интерактивный помощник для идентификации объектов. Автоматическое многоканальное 2D и 3Dотслеживание объектов во времени. Визуализация и количественная оценка перемещения объектов.

SVI-SmS

Small Server (Малый сервер).

Сервер не более, чем на 2 сокета и 16 процессорных ядер (32-64 бит)

SVI-FFB

Special File-readers Option (Опция чтения особыхформатов файлов)

Поддержка чтения дополнительных форматов файлов. Для ознакомления перечня файлов, поддерживаемых Huygens Basics по умолчанию посетите страницу: http://www.svi.nl/FileFormats

Special File-readers позволяет открывать файлы Zeiss ZVI, Leica LIF, Olympus OIF, Zeiss LSM,Biovision IPL (Windows), Biovision IPM (Mac)

SVI-HuEss

Huygens Essential. Включает средство автоматизации batch-processor. Требует хотя-бы одной оптической опции..

Легкое в использовании программное обеспечение в стиле помощника для обработки одно и многоканальных изображений. Включены следующие визуальные инструменты: Twin Slicer со средствами измерения, Orthogonal Slicer, SFP Volume rendering, MIP projection,

Возможность рендеринга изображений для полиграфического качества постеров. Базовая версия включает поддержку 4 ядер в 64 битных процессоров на всех платформах.

SVI-HuCore

HuygensCore. Требует хотя-бы одной оптической опции...

Веб-ориентированное решение для деконволюции и визуализации. Поддерживает планирование. На Linux сервере работает как централизованная вычислительная система для нескольких пользователей.

Программное обеспечение HRM доступно для загрузки на sourceforge.

1) Идеально для настройки под Linux и Apache с PHP и базой данных

2) Удаленное конфигурирование и установка HRM

3) Включает 2 дневное обучение в офисе SVI в Нидерландах (не более 2 человек, переезд и проживание не оплачивается)

4) Две гибкие или установочные лицензии для визуализации и анализа изображений для распространения системным администратором

SVI-MedS

Medium Server. (Среднийсервер)

Сервер не более, чем на 4 сокета и 48 процессорных ядер (32-64 бит)

SVI-LaS to SVI-XLaS

Large Server to Extra Large Server (Крупный и сверхкрупный сервер).

Серверы на 8 сокетов и 128 процессорных ядер (32-64 бит) или больше.

SVI-MN- HuPro

Huygens Professional

Широкие возможности для деконволюции изображений с возможностью выбора множества различных алгоритмов. Измерения функций рассеивания (PSF). 4-мерные срезы и проекции. Множество инструментов анализа. 64-битные версии для всех платформ.

SVI-MN-CF

Confocalopticaloption(Оптическая опция для конфокальной микроскопии). Позволяет проводить обработку изображений с учетом свойств, указанных в файлах для конфокальных снимков

SVI-MN-WF

Widefield & Brightfield optical option(Оптическая опция для широкопольной и светлопольной микроскопии). Позволяет учитывать параметры и особенности широкопольных снимков. Тестирование и коррекция мерцания, нестабильности ламп освещения, …

SVI-MN-NK

Spinning Disc optical option (Оптическая опция для микроскопии с вращающимся диском). Позволяет проводить обработку изображений с учетом свойств, указанных в файлах для снимков, сделанных на микроскопах с вращающимся диском.

SVI-MN-PSF

PSF Distiller. Опциональный помощник для измерения функций рассеивания (Point Spread Function) в программах Huygens Essential и Professional.

SVI-MN-MP

Multi photon optical option (Оптическая опция мультифотонной микроскопии). Позволяет учитывать особенности и свойства снимков, полученных с помощью мультифотонной микроскопии.

SVI-MN-TIME

Timeoption (Опция для работы с временными рядами) 

Просмотр и вырезание в 4-мерных стеках изображений. Объемная деконволюция с учетом коррекции мерцания для любых типов микроскопов. Коррекция Z-дрейфа для конфокальных и мультифотонных серий изображений. Коррекция изменений фона со временем. Все виды коррекции выполняются одновременно за 1 проход. Коррекции во времени: 4D Gaussian, Laplacian, PlotFlux.

SVI-MN-VIZM

Visualization & Analysis bundle (Пакет анализа и визуализации) доступно 4 опцииРендеринг поверхности - Surface RendererАнализ колокализации по пикселям - Co-localization Analyzer (pixel based)Анализ колокализации с учетом объектов - Object Analyzer & Co localization (Object based)Создание анимаций - MovieMaker 

SVI-MN-OS

ObjectStabilizer (Стабилизатор объектов)Помощник для стабилизации изображения для 2D и 3D временных серий, а также для срезов в 3D-сериях. Измерения и коррекция смещения объектов на субпиксельном уровне, например движения клеток, температурного дрейфа или дрожания.

SVI-MN-OT

ObjectTracking (Отслеживание объектов). Интерактивный помощник для идентификации объектов. Автоматическое многоканальное 2D и 3D отслеживание объектов во времени. Визуализация и количественная оценка перемещения объектов.

SVI-MN-SmS

Small Server (Малый сервер). Сервер не более, чем на 2 сокета и 16 процессорных ядер (32-64 бит)

SVI-MN-FFB

SpecialFile-readersOption (Опция чтения особых форматов файлов)Поддержка чтения дополнительных форматов файлов. Для ознакомления перечня файлов, поддерживаемых Huygens Basics по умолчанию посетите страницу: http://www.svi.nl/FileFormatsSpecial File-readers позволяет открывать файлы Zeiss ZVI, Leica LIF, Olympus OIF, Zeiss LSM, Biovision IPL (Windows), Biovision IPM (Mac)